Kampus IAIN Sultan Syarif Qasim Pekanbaru (IAIN Suska Pekanbaru) mendirikan Program Studi Sistem Informasi pada tahun ajaran 2002/2003 yang sejalan dengan rencana meningkatkan status IAIN menjadi Universitas Islam Negeri (UIN) Riau yang telah terlaksana saat ini. Hal ini didukung oleh Pemerintah Daerah Provinsi Riau, DPRD Riau, dan masyarakat, dimana sarjana lulusan teknik sangat banyak dibutuhkan dunia kerja (pasar) pada masa yang akan datang. Terutama menyambut era otonomi daerah. Program Studi yang strategis ini juga menopang Fakultas Sains dan Teknologi serta dalam pengembangan studi Islam pada millenium ketiga. IAIN Susqa Pekanbaru yang saat ini telah berubah menjadi Universitas Islam Negeri Sultan Syarif Kasim Riau atau yang disingkat dengan UIN Sultan Syarif Kasim Riau atau juga yang lebih familiar disebut UIN Suska Riau merupakan salah satu institusi pendidikan Islam negeri yang ada di Provinsi Riau yang mencermati dan berupaya menjawab tantangan masa depan dengan mendirikan Program Studi Sistem Informasi.